Dependencias

• Despacho del Contralor General de la República
• Despacho del Vicecontralor
• Secretaría Privada

Oficinas de Apoyo

• Oficina de Comunicaciones y Publicaciones
• Oficina Jurídica
• Oficina de Control Interno
• Oficina de Control Disciplinario
• Centro de Estudios Fiscales
• Fondo Cuenta de Capacitación y Publicaciones
• Oficina de Planeación
• Oficina de Sistemas e Informática

Unidades Especiales de Apoyo

• Dirección de Información, Análisis y Reacción Inmediata – DIARI-
• Unidad de información
• Unidad de Análisis de la Información
• Unidad de Reacción Inmediata
• Unidad de Investigaciones Especiales contra la Corrupción
• Unidad de Seguridad y Aseguramiento Tecnológico e Informático
• Unidad de Cooperación Nacional e Internacional de Prevención, Investigación e Incautación de Bienes
• Unidad de Apoyo Técnico al Congreso
• Unidad de Seguimiento y Responsabilidad Fiscal a Regalías

Gerencia de Talento Humano

• Gerencia de Talento Humano
• Dirección de Talento Humano
• Dirección de Carrera Administrativa

Gerencia Administrativa y Financiera

• Gerencia Administrativa y Financiera
• Dirección Financiera
• Dirección de Contratación
• Dirección de Infraestructura, Bienes y Servicios

Contralorías Delegadas

• Contraloría Delegada para la Participación Ciudadana
• Contraloría Delegada para Economía y Finanzas Públicas
• Contraloría Delegada para el Posconflicto
• Contraloría Delegada para Población Focalizada

Contralorías Delegadas Sectoriales

• Contraloría Delegada Sector Agropecuario
• Contraloría Delegada Sector Minas y Energía
• Contraloría Delegada Sector Salud
• Contraloría Delegada Sector Trabajo
• Contraloría Delegada Sector Educación, Ciencia y Tecnología, Cultura, Recreación y Deporte
• Contraloría Delegada Sector Inclusión Social
• Contraloría Delegada Sector Infraestructura
• Contraloría Delegada Sector Tecnologías de la Información y las Comunicaciones
• Contraloría Delegada Sector Vivienda y Saneamiento Básico
• Contraloría Delegada Sector Comercio y Desarrollo Regional
• Contraloría Delegada Sector Gestión Pública e Instituciones Financieras
• Contraloría Delegada Sector Defensa y Seguridad
• Contraloría Delegada Sector Justicia
• Contraloría Delegada Sector Medio Ambiente
• Contraloría Delegada para la Responsabilidad Fiscal, Intervención Judicial y Cobro Coactivo

Gerencias Departamentales Colegiadas

• Gerencia Departamental Colegiada Amazonas
• Gerencia Departamental Colegiada Antioquia
• Gerencia Departamental Colegiada Arauca
• Gerencia Departamental Colegiada Atlántico
• Gerencia Departamental Colegiada Bolívar
• Gerencia Departamental Colegiada Boyacá
• Gerencia Departamental Colegiada Caldas
• Gerencia Departamental Colegiada Caquetá
• Gerencia Departamental Colegiada Casanare
• Gerencia Departamental Colegiada Cesar
• Gerencia Departamental Colegiada Chocó
• Gerencia Departamental Colegiada Córdoba
• Gerencia Departamental Colegiada Guainía
• Gerencia Departamental Colegiada Guajira
• Gerencia Departamental Colegiada Guaviare
• Gerencia Departamental Colegiada Huila
• Gerencia Departamental Colegiada Magdalena
• Gerencia Departamental Colegiada Meta
• Gerencia Departamental Colegiada Nariño
• Gerencia Departamental Colegiada Norte de Santander
• Gerencia Departamental Colegiada Putumayo
• Gerencia Departamental Colegiada Quindío
• Gerencia Departamental Colegiada Risaralda
• Gerencia Departamental Colegiada San Andrés
• Gerencia Departamental Colegiada Santander
• Gerencia Departamental Colegiada Sucre
• Gerencia Departamental Colegiada Tolima
• Gerencia Departamental Colegiada Valle del Cauca
• Gerencia Departamental Colegiada Vaupés
• Gerencia Departamental Colegiada Vichada